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An expanded evaluation of protein function prediction methods shows an improvement in accuracy / Jiang, Yuxiang; Oron, Tal Ronnen; Clark, Wyatt T.; Bankapur, Asma R.; D'Andrea, Daniel; Lepore, Rosalba; Funk, Christopher S.; Kahanda, Indika; Verspoor, Karin M.; Ben Hur, Asa; Koo, Da Chen Emily; Penfold Brown, Duncan; Shasha, Dennis; Youngs, Noah; Bonneau, Richard; Lin, Alexandra; Sahraeian, Sayed M. E.; Martelli, Pier Luigi; Profiti, Giuseppe; Casadio, Rita; Cao, Renzhi; Zhong, Zhaolong; Cheng, Jianlin; Altenhoff, Adrian; Skunca, Nives; Dessimoz, Christophe; Dogan, Tunca; Hakala, Kai; Kaewphan, Suwisa; Mehryary, Farrokh; Salakoski, Tapio; Ginter, Filip; Fang, Hai; Smithers, Ben; Oates, Matt; Gough, Julian; Törönen, Petri; Koskinen, Patrik; Holm, Liisa; Chen, Ching Tai; Hsu, Wen Lian; Bryson, Kevin; Cozzetto, Domenico; Minneci, Federico; Jones, David T.; Chapman, Samuel; Bkc, Dukka; Khan, Ishita K.; Kihara, Daisuke; Ofer, Dan; Rappoport, Nadav; Stern, Amos; Cibrian Uhalte, Elena; Denny, Paul; Foulger, Rebecca E.; Hieta, Reija; Legge, Duncan; Lovering, Ruth C.; Magrane, Michele; Melidoni, Anna N.; Mutowo Meullenet, Prudence; Pichler, Klemens; Shypitsyna, Aleksandra; Li, Biao; Zakeri, Pooya; Elshal, Sarah; Tranchevent, Léon Charles; Das, Sayoni; Dawson, Natalie L.; Lee, David; Lees, Jonathan G.; Sillitoe, Ian; Bhat, Prajwal; Nepusz, Tamás; Romero, Alfonso E.; Sasidharan, Rajkumar; Yang, Haixuan; Paccanaro, Alberto; Gillis, Jesse; Sedeño Cortés, Adriana E.; Pavlidis, Paul; Feng, Shou; Cejuela, Juan M.; Goldberg, Tatyana; Hamp, Tobias; Richter, Lothar; Salamov, Asaf; Gabaldon, Toni; Marcet Houben, Marina; Supek, Fran; Gong, Qingtian; Ning, Wei; Zhou, Yuanpeng; Tian, Weidong; Falda, Marco; Fontana, Paolo; Lavezzo, Enrico; Toppo, Stefano; Ferrari, Carlo; Giollo, Manuel; Piovesan, Damiano; Tosatto, Silvio C. E.; del Pozo, Angela; Fernández, José M.; Maietta, Paolo; Valencia, Alfonso; Tress, Michael L.; Benso, Alfredo; DI CARLO, Stefano; Politano, GIANFRANCO MICHELE MARIA; Savino, Alessandro; Rehman, Hafeez Ur; Re, Matteo; Mesiti, Marco; Valentini, Giorgio; Bargsten, Joachim W.; van Dijk, Aalt D. J.; Gemovic, Branislava; Glisic, Sanja; Perovic, Vladmir; Veljkovic, Veljko; Veljkovic, Nevena; Almeida e. Silva, Danillo C.; Vencio, Ricardo Z. N.; Sharan, Malvika; Vogel, Jörg; Kansakar, Lakesh; Zhang, Shanshan; Vucetic, Slobodan; Wang, Zheng; Sternberg, Michael J. E.; Wass, Mark N.; Huntley, Rachael P.; Martin, Maria J.; O'Donovan, Claire; Robinson, Peter N.; Moreau, Yves; Tramontano, Anna; Babbitt, Patricia C.; Brenner, Steven E.; Linial, Michal; Orengo, Christine A.; Rost, Burkhard; Greene, Casey S.; Mooney, Sean D.; Friedberg, Iddo; Radivojac, Predrag. - In: GENOME BIOLOGY. - ISSN 1474-760X. - ELETTRONICO. - 17:1(2016), pp. 1-19. [10.1186/s13059-016-1037-6] 1-gen-2016 BENSO, ALFREDODI CARLO, STEFANOPOLITANO, GIANFRANCO MICHELE MARIASAVINO, ALESSANDRO + GENBIO.2016.CAFA2.pdf
Genome-wide analysis identifies a functional association of Tet1 and Polycomb repressive complex 2 in mouse embryonic stem cells / Francesco, Neri; Danny, Incarnato; Anna, Krepelova; Stefania, Rapelli; Pagnani, Andrea; Zecchina, Riccardo; Caterina, Parlato; Salvatore, Oliviero. - In: GENOME BIOLOGY. - ISSN 1474-760X. - STAMPA. - 14:(2013), p. R91. [10.1186/gb-2013-14-8-r91] 1-gen-2013 PAGNANI, ANDREAZECCHINA, RICCARDO + -
RNAs competing for microRNAs mutually influence their fluctuations in a highly non-linear microRNA-dependent manner in single cells / Bosia, Carla; Sgrò, Francesco; Conti, Laura; Baldassi, Carlo; Cavallo, Federica; Di Cunto, Ferdinando; Turco, Emilia; Pagnani, Andrea; Zecchina, Riccardo. - In: GENOME BIOLOGY. - ISSN 1474-760X. - ELETTRONICO. - 18:(2017), pp. 17-30. [10.1186/s13059-017-1162-x] 1-gen-2017 BOSIA, CARLABALDASSI, CARLOPAGNANI, ANDREA + s13059-017-1162-x.pdf
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